“小秋今天就是你返回的日子，你知道吗。”“我知道的梦馨姐。”“剩下的我也不多说了，万事小心，再加上现在又可以打卡了。”“我知道了梦馨姐。\\\"
随着一阵白光小秋回到了原来自己消散的那个位置，看着这里，小秋感觉有些硌得慌。便急忙离开了这里，不知道离开的这段日子剧情到哪里了 。
在小秋还没回来之前，而且姬矢准也消失了，这段时间里发生了许多事情，异生兽依然继续出现，这时一个蓝色的奈克赛斯站立于众人眼前。 战斗过后，孤门在附近一带搜查时，发现一个可疑的少年，于是便跟踪他。从伤势上，孤门可以肯定这少年便是适能者。孤门道明来意后，与少年千树怜成为了好友，并承诺会保守秘密。tLt亦对千树怜起了疑心，派出mp的野野宫瑞生跟踪怜。不过瑞生不但跟踪失败，还与怜成为了朋友，甚至开始爱上了他。在孤门和瑞生追查下，发现怜与一个名为“普罗米修斯之子计划”有关。在说明者的说明下得知这是一个优质因子婴儿的培育计划，怜是从美国逃出来的。
在终焉之地之战后失踪的沟吕木真也再次出现，但却失去了记忆。他更与一个父母被他间接杀害的小女孩为伴。后来沟吕木被tLt捉住，在囚室间他恢复了记忆，更得知自己只是黑幕的傀儡，沟吕木决定在死前与那女孩再见面，于是挟持瑞生离开。在同一时间，未知之手将黑暗梅菲斯特的力量与mp的三泽广之融合，诞生了黑暗梅菲斯特第二代，向众人袭来。
此时的众人正包围着逃跑的沟吕木，正当沟吕木束手就擒时，从他的后方被人开枪洞穿了 。西条凪他们看见开枪的人居然是“三泽先生。”
“呵呵。”三泽笑着走过来说道“沟吕木真也，你已经没用了，从现在开始，我来替代你，将这个世界涂满黑暗。”
在大家一脸震惊中，三泽掏出了变身器。一阵黑暗闪过“黑暗梅菲斯特。”
远处的千树怜感知到有敌人出现了，急忙奔跑着拿出了进化信赖者变身成了奈克瑟斯。
见黑暗梅菲斯特出现，孤门他们急忙撤离。“快来往这边撤退。”
可黑暗梅菲斯特2号却不会让他们如意，发射光弹炸向他们，孤门他们只能拼命的奔跑以此来躲避攻击。
在后面的西条凪对他们说道“你们先走。”“但是.......”“你一定要保护好她。快走吧。”
眼见黑暗梅菲斯特2号步步紧逼，孤门也只好答道“是，副队长你要小心啊。”说完带着人先走了。
见黑暗梅菲斯特2号离自己不远，西条凪举起手里的手枪，勇不畏惧的对准了他朝他射去。
被击中的黑暗梅菲斯特2号认为这是对他赤裸裸的挑衅，刚准备对西条凪发起攻击。被以光球化赶过来的奈克瑟斯一击撞飞。
黑暗梅菲斯特被这一击撞得两脚朝天，连续滚了好几天才停下来。
见到奈克瑟斯出现，大家心里都安下心了。“奥特战士。”孤门高兴的说道。
见到是奈克瑟斯出现，黑暗梅菲斯特黑色的双眼由怒转为通体发红，象征了仇人见面分外眼红啊。
两人同时冲向对方，黑暗梅菲斯特2号冲过去就要给奈克瑟斯一个大大的拥抱，但迎接他的是无情的顶击，接着黑暗梅菲斯特被撞翻，急忙起身与奈克瑟斯近身打了起来。
可惜他都是被动挨打，被奈克瑟斯打得连连败退，翻滚倒地，接着又起身不讲武德的拿出了自己随身携带的爪子。
使出爪子后黑暗梅菲斯特2号仿佛有了霸服加成，越战越勇打得连连败退。
在不远处刚刚才到没多久的小秋把这一切看在眼里。“叮，现在发布打卡任务，请在奈克瑟斯转换为蓝色青年形态后，在其不远处打卡。”“这么快就来奖励了呀，梦馨姐。”“肯定呀，都这么久没开张了，必须一有机会就放啊，而且这次的奖励还是挺丰富的。”“有什么奖励呀梦馨姐。”“秘密，到时候你就知道了。”“好吧。我也趁这个时间看看千树怜的这个奈克瑟斯怎么样。”“小秋你不去帮忙吗？”“帮忙肯定是要帮的，不过不是现在。”“哦！莫非你还想来你螳螂捕蝉黄雀在后呀。”“没想到被梦馨姐你猜到了。”“这不要猜好不。”“但你确定能行？”“放心，梦馨姐，不管行不行，在关键时刻我会出手的，再说，不是你让我小心吗，而且如今的我完全可以暗中帮忙嘛。”“你知道就行，那我先下线了，明天见，或者你直接 进系统空间也行。”“嗯我知道了梦馨姐，你让路西亚她别太担心我就行，就我还没痊愈的那几天，把我都喂胖了，她自己都瘦了，我下次进去，可要看见她长起来。”“放心，你现在又不是不能天天进来，到时候自己监督。就这样明天见，我去找路西亚追剧去了。”“哎，这个梦馨姐，自从路西亚进去后，就越来越不负责了。算了，我还是好好看他们战斗吧，在关键时刻好帮助奈克瑟斯，我绝不是眼馋那个奖励，绝不是。”
在奈克瑟斯被黑暗梅菲斯特2号的爪子狠狠抓出火花后，就一直在闪躲，往后翻滚时切换为 了蓝色青年形态。
“叮，恭喜你小秋打卡成功，获得究极无限凤凰形态解锁完成5%获得弓箭光线风暴技能，以及奈克瑟斯解锁卡片70%，没想到你这么快就打卡了。”“我也没想到这么快，没想到这次的奖励这么好。”“后面也不好说，奖励都是随机的，主要是因为再次回归打卡，才这么好，我这次是真走了小秋，刚刚追剧正看到精彩的部分呢。”“快去吧梦馨姐！”
在奈克瑟斯换成蓝色青年形态后，马上飞上了高空，黑暗梅菲斯特2号紧紧跟在后面发射切割光线攻击奈克瑟斯，但都被奈克瑟斯依依闪开。
于是他又聚集了一发更大的光弹发射而去，在途中分解成无数的小光弹射向奈克瑟斯，这些光弹被奈克瑟斯尽数闪过。
见被闪过冲上去靠近奈克瑟斯对他使出无影拳，但依旧被奈克瑟斯敏捷的身法全部躲过。
但他没有放弃依旧挥舞着爪子，最终功夫不负有心人终于抓到了奈克瑟斯一击把他打落高空，随后又补了一脚，重重摔在凹凸不平的山上。