神族曾经的家园艾尔行星，如今已经被重寻摧毁，昔日高高在上的神族彻底沦为了难民。今天神族强势归来，势必要收复属于他们心灵异族的故乡。
重庆已然开始冲锋，神圣的卡拉恋，接着每一位神族的思想因此无需多言。面对着无边无际的虫海大军，战士们毅然而然挥起手中的任务，必要在他们牺牲之前保护水晶塔建造完成，让神族大军哲学探机。
此时已经打开了传送门，突然从地下冒出几只毒爆虫狂热者，看到建筑受到威胁，奋起阻挡不到虫的自杀式撞击。
在最后一点灵能耗尽之前，撞向了致命的毒爆虫。虽然成功保护了建筑，但是自己也彻底牺牲，魂归他了。
另一边，攻击能力相对弱小的盛唐武士遭到了跳床的强力进攻，两位圣堂武士重新站起身来，身后是他们是死在保卫上的。卓越的技术，源源不断的虫海再次从坡上冲，一只雷兽也从地里钻出，这对弱小的心灵部队来说，完全是一个噩耗。
两名盛唐武士已经做好了决定，他们手中绽放着电，电闪雷鸣之间。光明执政官正式登场。执政官手中放出一道灵魂之光，电光所到之处，一排排跳虫瞬间化为血水。
不过，弱小的跳虫被歼灭后，庞然大物的雷兽还在进步，雷兽冲向光明，执政官，将他抵在了石壁之上。
正当他扬起一只巨拳，准备割裂他的手，执政官拼死抓住巨钳，再次放出灵能冲击雷射的钳子虽然被切断，但是执政官仍然处于劣势。执政关键刑事紧急就放弃了自我，任由能量消散，最终产生了一个小型黑洞，一道白光闪过，执政官与雷兽彻底同归于尽。
随着小分队的逐渐牺牲，战场上也只剩下了最后一名心灵战士，但是他目光依然坚定，面对着远处的一重大军，他艰难的站起身来，亮出了手中的灵能力量。正是这种虽千万人吾往矣的精神，身后的水晶塔此时终于成型，源源不断的心灵战士折叠到了战场。
今天他们就要夺回他们的家园，夺回属于他们的遗产。神族的荣耀。虚空之中，大主教阿塔尼斯正在对全体心灵同胞进行演讲，号召战士们光伏埃尔泽拉图知晓的预言前来阻止阿塔尼斯光伏埃尔的战斗必须取消。共同的敌人是黑暗之神埃蒙，他已经复活，可是阿塔尼斯已经西湖南下，战士们正斗志昂扬，每一位圣堂武士无不渴望的收复家园，于是战斗打响。
在埃尔登陆战中，他们获得了全面胜利，心灵仿佛获得了夺回家园的希望。此时，泽拉图告知了阿塔尼斯他所知道的真相，用来净化刀锋女王的萨尔。那家神器是一个钥匙，钥匙是打败埃蒙的关键。于是他们决定分头行动。
阿塔尼斯率领黄金舰队流水，并清理艾尔泽拉图，去寻找吉姆雷诺索取钥匙。可是情况有变，等到泽拉图带回钥匙找到阿塔尼斯时，发现阿塔尼斯已经被艾伦完全控制。
泽拉图想要切断链接阿塔尼斯的神经术，失去理智的阿塔尼斯2话不说便向泽拉图痛下杀手。泽拉图与之交战的过程中，始终没有机会触碰到他的身体，处于是泽拉图下定决心用身体迎接了阿塔尼斯的致命一击。
利用这个机会，则拉图切断了他的神经术。阿塔尼斯恢复了意识，而泽拉图则死在了他的光刃之下，一代传奇就此湮灭，留下的只有他的灵能。光荣现状由不得阿塔尼斯沉溺于悲伤之中，他带着残存的部队，找到像位技师凯拉克斯。
他们准备启动心灵，在鼎盛时期所贮存的就是方舟亚顿之矛。于是这艘代表着最后希望的方舟就此离开了他们的母亲。经过短暂的折跃后，阿塔尼斯来到了萨尔那家神殿。在神殿内，阿塔尼斯看到了萨尔那家的预言图，就在此时，身后的墙壁轰然倒塌。
重组女王凯瑞甘从混合体的尸体下面爬了出来。阿塔尼斯看着昔日的敌人身处面前，正要展开战斗，两人还没来得及对话，又一只混合体冲了进来。虚弱的凯瑞甘与混合体展开了战斗，但它明显不敌被混合体不断的柔理。
阿塔尼斯无法坐视这一切的发生随之与混合体展开了激斗。而一旁的凯瑞甘藉此机会不断的恢复，在阿塔尼斯陷入危险之际，彻底消灭了这个混合体。随后，他们两个放下了薪酬，就恨一同走进了神殿之中。
在走入神殿后，他们发现所有萨尔那家都已经被杀死，所剩下的只不过是一具具庞大的尸体。此时，身后突然传来黑暗之神埃蒙的声音。埃蒙显摆自己吸取了主宰的精华，已经有了一个完美的肉体，很快就可以毁灭世界。
于是三足就此形成连续帝国舰队加黄金舰队加虫群大军，一股脑进入了虚空之中，准备给埃蒙展开最终的决战。在进入虚空之门后，他们在这里见到了最后一名萨尔那家奥克斯艾蒙已经和虚空融为了一体，自己被埃蒙囚禁于此处。
奥鲁斯说出了打败埃蒙的方法，那就是获得萨尔那家的力量，而唯一能承受这股力量的人，只有凯瑞甘。随后凯瑞甘汲取了奥鲁斯所有的精华，从虫族女王进化成了圣光女神，新的神明就此诞生。凯瑞干成神后，动用全部的神力，把黑暗之神埃蒙轰成了渣渣。
两年之后，雷诺独自在小酒馆里喝着闷酒。电视里报道，新帝国成立三周年的纪念日，雷诺看着墙壁上的照片，回忆起过。他想起了曾经的种种美好，如今却都离他远去。
正当他惆怅万千之时，酒馆的大门突然被打开，并且散发着金光。雷诺回头一看，并淡然一想，一位红发幽灵女特工正站在门口。牛仔准备出发了。也该是时候了。