12月12日下午，唐生智下达撤退命令，但由于命令下达失误，导致约十万中国守军滞留江边，除少数部队顺利渡江，及部分从其他方向撤退的中国守军顺利突围外，大部分滞留江边的中国守军成为战俘。
城陷之前，在日军进攻南京的过程中，曾组织“杀人比赛”。1937年11月27日，日军第16师团步兵第9联队的少尉军官向井敏明和野田毅，在进军南京的途中以谁先杀满100人为胜的方式开展“百人斩”竞赛。
12月10日，向井敏明和野田毅两人在南京东郊会面，此时他们的成绩为106:105，但无法确定谁先达到100人，于是改以150人为目标。
12月13日，下午日军迂回包抄至南京挹江门外的下关，并用机枪、步兵炮等武器杀死正在渡江和困在江边的中国军民。之后日军将大批投降的军民分批押往下关一带（集中在中山码头、煤炭港等地）进行集体屠杀。
这只是其中几个例子，屠杀仍在继续。
被俘虏的军民，被接连不断的大规模射杀焚尸。
曾经繁华的民国首都，曾经叫金陵、又叫应天府，现在却到处是残垣断壁，硝烟将一切熏的黝黑。
南京沦陷三天后，整座城市陷入了无尽的黑暗与恐怖之中。
街道上，硝烟弥漫，废墟随处可见。房屋被炸毁，残垣断壁诉说着战争的残酷。曾经繁华的街市变得死寂，店铺被洗劫一空，门窗破碎，货物散落一地。
空气中弥漫着刺鼻的硝烟味和血腥气。路边横七竖八地躺着尸体，有平民百姓的，也有士兵的。他们的面容扭曲，充满了痛苦和绝望。鲜血染红了大地，汇聚成一条条触目惊心的溪流。
失去亲人的人们在街头哭泣、呼喊，声音中充满了悲痛和无助。孩子们惊恐的眼神令人心碎，他们不知道未来在哪里，也不知道下一刻是否还能活着。
日军在城中肆意横行，烧杀抢掠，无恶不作。他们的暴行让南京变成了人间地狱，恐惧笼罩着每一个角落。整个城市失去了生机与希望，只剩下无尽的哀伤与绝望。
………………
何大清带领特战团通过神秘的空间裂缝抵达南京城下关区一处偏僻的废弃工厂附近。这里，废弃的建筑物东倒西歪，堆积的杂物杂乱无章，却成了天然的障碍物与掩体。在这被战火笼罩的南京城，每一步都可能暗藏杀机，他们深知任何冒进都可能带来灭顶之灾。
特战团成员们迅速进入高度戒备的战斗状态，在何大清的严肃指挥下分成多个小组，如幽灵般开始对周边环境进行细致侦查。他们身姿矫健，灵活地在废墟和残破的建筑物之间穿梭，每一步都小心翼翼，仿佛在刀尖上行走。他们的眼神中透露出坚定与警惕，不放过任何一丝可能的危险信号。
“都小心点，这里情况不明，随时可能遭遇敌人。”何大清低声叮嘱道。
“是，总长！”特战团.团长石头轻声回应。
团长石头吩咐说着“各营，以连排作为作战单位，互相支援作战，切记不可浪战，打完即撤，和小鬼子打巷战，游击战，运动战……”
“遇到民众，救出来后，暂时找隐蔽地点安置，总长有任何作战安排和其他指示都会传达给各营营长，各营连排随时保持联络畅通，行动”。
………………
在紧张的侦查过程中，一个令人愤慨的场景映入眼帘。一小队日军如饿狼般在附近的街区横行霸道，肆意搜刮财物，对无辜百姓拳打脚踢。百姓们惊恐的眼神和绝望的哭喊让特战团成员们怒火中烧。
“总长，小鬼子太过分了！”一名队员咬牙切齿地说道。
何大清目光一凛，果断下令行动。“一组，从侧翼悄悄接近，二组在远处找位置，准备提供火力支援。”
一组队员如同猎豹般从侧翼悄然接近，他们脚步轻盈，动作敏捷，巧妙地利用地形和阴影，一点一点地靠近目标。每个人都紧紧握着手中的武器，心跳与呼吸都控制得恰到好处，仿佛与周围的环境融为一体。
“注意脚步，别弄出声响。”一组组长低声提醒道。
与此同时，另一组队员则在远处寻找合适的位置，准备为侧翼的战友提供火力支援。他们冷静地调试着武器，眼神专注地盯着日军的动向，等待着最佳的射击时机。
“瞄准了，等一组动手，我们立刻开火。”二组组长说道。
当侧翼小组靠近到合适距离时，队长一个手势，队员们如同猛虎下山般突然发动袭击。他们动作迅猛，手中的武器如闪电般刺向日军。
一名日军还未反应过来，就被利刃刺穿胸膛，“噗”的一声，鲜血喷涌而出。另一名日军刚要转身，却被一记重拳打得头晕目眩，紧接着被一刀抹了脖子，“嗖”的一声，刀刃划过空气。
几个日军在这迅雷不及掩耳之势的攻击下瞬间倒地，他们甚至来不及发出一声惨叫。
远处的火力支援组也在同一时刻精准射击，“砰砰砰”，子弹如流星般划过空气，准确地命中目标。
日军被这突如其来的攻击打得措手不及，慌乱中试图反击，但却被火力死死压制住。他们如同无头苍蝇般四处逃窜，却逃不过特战团的精准打击。
战斗在瞬间结束，特战团成员们没有丝毫犹豫，迅速搜刮小鬼子身上的武器弹药。
他们动作熟练而迅速，不放过任何一个有用的资源。有的队员小心地从日军尸体上取下枪支和弹药，有的则收集着情报文件。
“动作快点，别耽误时间。”有人催促道。
这时，被解救的老百姓看着这群突如其来的军队，心中充满了陌生和畏惧感。但看到他们在杀小鬼子，直觉告诉他们，这可能是之前守卫南京城的国军，但不知道是哪一部分。看着他们一个个装备精良，脸上一个个都抹着迷彩涂料。
有大胆的几个青年人，主动上前搭话。
回应他们的是特战团的一个排长，姓余所以被人叫老余。老余看着他们，严肃地说道：“我们不是国军，但我们是中国人。现在马上跟我们离开这个是非之地。”简短截说回应了几句，就马上结束了话头，因为是非之地不宜久留。
这几个被救的民众，莫名的感觉心里安定了不少，仿佛抓住了救命稻草一样。
没再质疑，乖乖的听从吩咐。
之后排长老余带着这九个男女老少，迅速地离开了战斗现场。
一个排分成了三个战斗小组，分为了火力支援、近战、辅助。
撤退时也是一个小组负责前面，十分警惕的搜索前进，另一个小组负责垫后，剩下一个小组负责随时支援前后。
有序快速的撤退，并不是慌乱的逃跑。
他们的身影在废墟中穿梭，脚步匆忙而坚定，仿佛在与时间赛跑。