在50年代的石太线上，有一个不起眼的小站——豆妪站。这个站点虽小，却因为一系列诡异的事故而声名狼藉。王大刚，豆妪站的站长，一个平日里沉默寡言的男人，对这些事故背后的秘密充满了好奇和忧虑。
夏天的一个早晨，阳光明媚，村民们像往常一样在铁路两边的农田里劳作。6岁的小姑娘叶子，挎着篮子，走出家门，踏上了通往田野的小路。她的任务是去割草，却不知不觉地走到了铁路中间，这个被村民们视为不祥之地。
远远地，火车的汽笛声响起，但叶子却像是被某种力量定住了一样，站在铁路中间，一动不动。农田里的村民们开始大声呼喊，但叶子似乎听不见任何声音，只是呆呆地站着。
火车越来越近，叶子突然像是从梦中惊醒，开始惊慌失措地寻找逃生的路。但每当她试图跑向一侧，却又像是被无形的力量推回铁路中央。村民们停下了手中的农活，纷纷冲向铁路，女人们尖叫着，但一切都显得那么无力。
火车呼啸而过，带着无法挽回的悲剧。当一切安静下来，人们只在铁路旁找到了几根头发和叶子的空篮子。出事地点离那个被认为是凶地的道口不足200米，村民们议论纷纷，有人说，这是那个道口的怨灵在找替身。
王大刚站在事故现场，眉头紧锁。他知道，这已经不是第一次发生这样的事故了。每次事故都伴随着无法解释的现象，让人们不禁怀疑，是不是真有某种邪恶的力量在作祟。
王大刚作为豆妪站的站长，对这起事故感到责无旁贷。他决定深入调查，希望能找到事故频发的真正原因。他首先查阅了车站的档案记录，发现自车站建立以来，类似的事故已经发生过多次，每一次都是在那个不祥的道口。
在档案中，王大刚发现了一些令人不安的线索。这些事故的受害者在事发前都曾报告说，他们在道口附近感受到了一种不寻常的气氛，甚至有人声称看到了模糊的身影在铁路上徘徊。
王大刚决定在道口附近进行夜间巡逻，希望能亲眼看到那些传说中的灵异现象。一天夜里，他带着手电筒，独自一人来到了道口。夜色中，铁路两旁的田野显得格外寂静，只有偶尔传来的虫鸣声打破了沉默。
正当王大刚准备离开时，他听到了一阵微弱的哭泣声。他顺着声音寻找，发现哭泣声来自铁路下方的一个废弃的隧道。隧道口被藤蔓和杂草覆盖，显得阴森可怖。王大刚鼓起勇气，走进了隧道。
隧道内部阴暗潮湿，墙壁上长满了青苔。王大刚用手电筒照亮前方，发现隧道深处似乎有什么东西在闪烁。他走近一看，竟是一串古老的佛珠，佛珠上沾满了泥土，但在手电筒的光线下依然闪烁着微弱的光芒。
就在这时，王大刚感到一阵寒风吹过，佛珠突然发出了更加强烈的光芒。他听到了一个女子的声音在耳边低语，声音充满了悲伤和绝望。王大刚意识到，这串佛珠可能与道口的事故有关，那个女子的声音，或许就是那些受害者所看到的模糊身影。
王大刚紧紧握着那串佛珠，心中充满了疑惑和恐惧。他知道这串佛珠绝非凡物，它可能是连接生者与死者世界的钥匙。回到车站，他开始翻阅更多关于这个地区的历史资料，希望能找到与这串佛珠有关的线索。
在一本破旧的地方志中，王大刚发现了一段记载：几十年前，这个隧道曾发生过一起严重的塌方事故，一名年轻的女子在事故中不幸丧生。她的遗体被深埋在隧道中，从此再也没有被找到。女子的家人悲痛欲绝，他们相信女子的灵魂一直被困在隧道里，无法安息。
王大刚意识到，叶子和其他受害者的悲剧可能与这个女子的灵魂有关。他决定举行一场超度仪式，希望能够安抚她的灵魂，让她得到解脱。
在月圆之夜，王大刚带着佛珠和一些祭祀用品，再次来到了隧道口。他按照传统仪式，点燃了香烛，摆放了供品，然后开始念诵经文。随着经文的念诵，隧道内似乎有一股不寻常的气流在涌动，佛珠上的光芒也越来越亮。
突然，一阵冷风吹过，隧道内传来了女子的哭泣声。王大刚感到一股强烈的悲伤和不舍，但他坚定地继续念诵经文，希望能够引导女子的灵魂离开。随着时间的推移，哭泣声逐渐变得平和，最终消失在夜空中。
当一切恢复平静，王大刚感到一种前所未有的轻松。他相信女子的灵魂已经得到了解脱，不再徘徊在隧道中。他将佛珠留在了隧道口，作为对女子的纪念。
王大刚超度仪式的成功，让他确信那个女子的灵魂已经得到了安息。但当他回到村子时，却发现村民们对他的行为议论纷纷。有些人认为他打扰了亡魂的宁静，有些人则怀疑他是不是在掩盖什么不为人知的秘密。
面对村民们的质疑和不信任，王大刚没有选择逃避，而是决定站出来，向他们解释自己的所作所为。他召集了全村的大会，详细讲述了自己在隧道中的发现，以及超度仪式的整个过程。他坦诚地表达了自己对叶子和其他受害者的哀悼，以及对村庄安全的担忧。
王大刚的真诚打动了村民们，他们开始理解并支持他的做法。一些村民甚至主动提出要帮助改善道口的安全措施，防止类似的悲剧再次发生。在王大刚的带领下，村民们一起努力，为道口安装了警示标志和围栏，还在附近设立了看护人员。
随着时间的推移，豆妪站逐渐恢复了往日的平静。村民们不再害怕那个道口，孩子们也能安全地在铁路附近玩耍。王大刚的努力没有白费，他不仅平息了一个幽魂的怨气，也为村民们带来了实实在在的安全和安宁。
然而，王大刚知道，这个世界上还有许多未知的事物等待人们去探索和理解。他决定继续担任站长，同时也成为一名守护者，守护着豆妪站和村民们的平安。
故事以王大刚的坚守和村民们的团结互助作为结尾。《铁路悲魂：豆妪站长的诡秘档案》不仅是一个关于悬疑和惊悚的故事，更是一个关于勇气、理解和宽恕的故事。王大刚和豆妪站的村民们用他们的行动证明了，即使在面对超自然的力量时，人性的光辉也能够照亮黑暗，带来希望和安宁。