在成功阻止黑暗势力的疯狂实验后，林宇一行人带着疲惫与胜利的喜悦，驾驶着探索飞船缓缓离开了神秘维度。当飞船穿过连接维度的神秘入口，回到他们熟悉的宇宙时，众人都长舒了一口气。
然而，还没等他们来得及好好庆祝这来之不易的胜利，联合舰队总部就传来了紧急通讯。舰队指挥官的声音中带着一丝焦急：“林宇，你们回来得正是时候。在你们离开的这段时间，宇宙中出现了一系列异常现象。一些原本稳定的星系开始出现能量紊乱，还有部分星球的轨道发生了微妙变化。我们怀疑这与黑暗势力之前的行动有关，你们必须尽快返回基地，参与调查。”
林宇深知事情的严重性，他立刻命令飞船全速驶向宇宙中心的研究基地。回到基地后，林宇和队员们顾不上休息，马不停蹄地投入到新的研究和调查工作中。神秘文明的科学家们对从神秘维度带回的各种数据进行了更加深入的分析，而隐秘联盟的技术专家则利用先进的监测设备，对宇宙中出现异常的区域进行全方位扫描。
经过几天几夜的奋战，他们终于发现了一些关键线索。原来，黑暗势力在进行危险实验时，不仅引发了神秘维度的能量波动，还在宇宙中留下了一种特殊的能量印记。这种印记正在潜移默化地影响着周围星系的能量平衡和星球的运行轨道。如果不及时采取措施，整个宇宙的秩序都将受到严重威胁。
林宇和各方领袖紧急召开会议，商讨应对之策。经过一番激烈的讨论，他们决定组建一支由多个种族精英组成的宇宙修复舰队。这支舰队的任务是前往各个出现异常的星系，利用特殊的能量中和装置，消除黑暗势力留下的能量印记，恢复星系的正常秩序。
林宇被任命为修复舰队的总指挥。他深知这个任务的艰巨性，但他没有丝毫退缩。他开始精心挑选舰队成员，从各个种族中选拔出最优秀的战士、科学家和技术人员。艾丽娅自然也在其中，她凭借着在神秘维度中的出色表现，成为了舰队的核心成员之一。
在舰队出发前，林宇对全体成员发表了一番鼓舞人心的讲话：“我们刚刚经历了一场生死考验，成功拯救了两个维度。但现在，我们的宇宙又面临着新的危机。黑暗势力虽然暂时被击退，但他们留下的隐患却威胁着每一个星球、每一个生命。我们是宇宙的守护者，肩负着维护宇宙和平与秩序的重任。这一次，我们同样不能退缩，一定要全力以赴，让宇宙重新恢复往日的安宁！”
舰队成员们热血沸腾，纷纷表示将坚决完成任务。随着一声令下，修复舰队浩浩荡荡地出发了。他们首先来到了距离研究基地最近的一个异常星系。这个星系中的几颗行星已经偏离了原来的轨道，相互之间的引力作用也变得异常混乱。如果不及时纠正，这些行星很可能会发生碰撞，引发一场毁灭性的灾难。
林宇和队员们迅速行动起来。他们驾驶着飞船，围绕着异常行星展开细致的探测，确定能量印记的具体位置和强度。然后，他们利用能量中和装置，发射出一道道特殊的能量波，试图中和黑暗势力留下的能量印记。
在操作过程中，他们遇到了重重困难。能量中和装置的功率不够，无法完全消除强大的能量印记；部分行星周围存在着强大的磁场干扰，影响了装置的正常运行。但林宇和队员们并没有放弃，他们不断调整策略，改进装置。经过多次尝试，他们终于成功地中和了这个星系中的能量印记，行星们逐渐恢复了正常的轨道，星系的能量平衡也得到了恢复。
然而，宇宙中还有许多类似的异常星系等待着他们去修复。林宇和修复舰队的成员们继续踏上征程，他们在浩瀚的宇宙中穿梭，与时间赛跑，与未知的危险战斗。每一次成功修复一个星系，都让他们离最终的胜利更近一步。但他们也知道，前方的道路依然充满艰辛，还有更多的挑战在等待着他们……