就在姜仁等人的炮火不断轰击能量节点，裂缝逐渐扩大之时，神秘舰队的首领发出一阵狂笑，那笑声通过通讯频道传遍整个战场，充满了诡异与疯狂。
“你们以为摧毁这个节点就能破局？太天真了！” 神秘首领的声音回荡着，“这个能量节点不过是个诱饵，真正的危机，现在才开始！”
话音刚落，那些被卷入时空乱流的战舰周围，突然出现了无数闪烁的光影。仔细一看，竟是神秘舰队战舰的分身，这些分身迅速朝着姜仁团队的基地飞去。原来，神秘组织利用时空之力，制造出了拥有实体攻击能力的分身，目的是趁姜仁等人在外作战，一举摧毁他们的基地。
留在基地负责防守的队员们看到这一幕，顿时乱了阵脚。“怎么回事？怎么突然冒出这么多敌人？” 一名队员惊恐地喊道。
负责基地防御指挥的是年轻的战术专家艾丽，她深吸一口气，努力让自己镇定下来。“大家别慌，启动基地的全方位防御系统，重点防御能量核心区域和指挥中心！” 艾丽迅速下达指令，同时通过通讯设备向姜仁汇报情况。
姜仁听到基地告急的消息，心急如焚，但他知道此刻不能慌乱。“弗里曼、林晓，你们继续攻击能量节点，我回去支援基地！” 姜仁果断做出决定，驾驶着自己的战舰，开启最大功率的引擎，朝着基地飞速返回。
在返回基地的途中，姜仁发现那些神秘分身的攻击方式十分奇特，它们似乎能随意穿梭时空，躲避防御炮火，而且攻击带有强烈的时空震荡波，击中之处，防御设施纷纷瘫痪。姜仁一边躲避着分身的攻击，一边思考应对之策。突然，他想到了之前从神秘舰队武器碎片中解析出的能量波动频率。
“或许可以利用这个频率，制造出一种反向干扰波，扰乱他们的时空穿梭能力！” 姜仁心中一动，立刻联系基地的科研团队，让他们按照自己的思路研发干扰装置。
此时，基地的防御已经岌岌可危，神秘分身突破了外层防御，逐渐逼近能量核心区域。艾丽看着不断受损的防御设施，心中充满了绝望。“难道我们真的要失败了吗？”
就在这时，姜仁赶回了基地。他迅速将科研团队紧急研制出的干扰装置安装在基地的主防御系统上，启动开关。一股特殊的能量波动扩散开来，那些原本能随意穿梭时空的神秘分身，行动变得迟缓起来，有的甚至直接停滞在原地。
“成功了！” 艾丽兴奋地喊道。
姜仁趁机指挥基地的防御武器，对那些行动受限的神秘分身展开反击。一时间，炮火齐鸣，神秘分身纷纷被摧毁。
而在时空乱流核心区域，弗里曼和林晓也在全力攻击能量节点。能量节点的裂缝越来越大，即将达到崩溃的边缘。神秘舰队的首领见状，亲自驾驶旗舰赶来，试图阻止他们。
“想摧毁能量节点，先过我这一关！” 神秘首领驾驶着旗舰，释放出强大的时空护盾，普通的炮火根本无法对其造成伤害。
弗里曼看着眼前的旗舰，咬咬牙说：“看来只能用那招了！” 他和林晓对视一眼，两人驾驶着战舰，以极快的速度朝着旗舰冲去，同时开启战舰的最大功率引擎，将所有能量集中在船头。
“你疯了吗？” 神秘首领看着冲过来的两人，惊恐地喊道。
“为了胜利，拼了！” 弗里曼和林晓异口同声地说。就在即将撞上旗舰的瞬间，他们同时发射出特制的能量导弹，然后紧急转向。
“轰” 的一声巨响，能量导弹在旗舰的时空护盾上爆炸，产生的强大冲击力与能量节点的不稳定相互呼应，引发了连锁反应。能量节点终于承受不住，彻底崩溃，时空乱流也随之迅速消散。
神秘舰队失去了时空乱流的支持，实力大减。姜仁带领基地的防御力量与弗里曼、林晓会合，对神秘舰队展开最后的攻击。在姜仁团队的齐心协力下，神秘舰队终于被彻底击败。
然而，当姜仁等人以为危机解除时，从神秘舰队旗舰的残骸中，传出了一个神秘的信号。这个信号似乎在向遥远的宇宙深处发送着什么信息，姜仁团队又将面临怎样新的挑战？一切都还是未知……