每击败一个律者，人类都要付出沉重的代价。
在击败了第十一位律者——「约束之律者」之后，地球上近七成的文明都覆灭了。
在人类最顶尖的科学家mei和她设计的超级人工智能prometheus（普罗米修斯）的计算之中，律者应该共有十四位，而第十四位律者的力量，将远远超过其他律者。
在「最后的律者」面前，人类的结果只有灭亡。
人类唯一的希望，只有用律者的力量对抗律者，没错，就是「神之键」计划。
第六律者核心制成的——「深渊白花」。
第七律者核心制成的——「天火圣裁」。
第十律者核心制成的——「轩辕剑」。
以及......用第十一律者核心制成的——「犹大的誓约」。
在这个时候，第十二位律者出现了。
不同于其它的律者，虽然在这位少女体内检测到了剧烈的崩坏能反应，但她却没有任何特殊的能力。
——而且，她本人，依旧保持着「人」的意识。
虽然她看上去是一个弱小无助的少女，但对律者充满了恐惧的人们还是带走了她，并把她囚禁在「基地」的地下三十三层。
mei博士夜以继日地研究着少女身上的秘密，可惜......一无所获。
少女不断祈求着博士放她离开，让她回到自己的姐姐身边。
（侵蚀律者的姐姐是樱哦！那个融合了崩坏兽「夜叉」，会给你「刹那」的刻印的樱哦！怎么说呢......还是米忽悠狠呐，前文明和现文明樱和她妹妹都没啥好结果......）
虽说mei博士的内心也充满了困惑与不忍，但可惜，在真相被调查出来之前，她无法放任律者离开。
就这样，在漆黑的牢房之中，仍旧保有「人」的意识的少女，不断感受到孤独和害怕。
但噩梦才刚刚开始.....
在「约束惨案」之后，仅有十三位融合战士存活了下来，他们被称为「逐火十三英桀」。
Aponia，阿波尼亚，逐火十三英桀第三位，掌握着「戒律」之铭，融合了崩坏兽「密多罗」dNA的她有着影响他人行为以及预测未来的能力，在「约束惨案」发生之后，人心涣散，她大面积散播着自己的「戒律」——“永远不会放弃对抗崩坏的希望”。
......
阿波尼亚出生于黄昏街，也在那长大，从未离开过那里。
阿波尼亚有一种天赋，这让她能轻易地说服别人。
崩坏爆发后，一种死亡率百分之百的“崩坏病”出现在世界各地。之后阿波尼亚将一些崩坏病的感染源收容并聚集在她所在的一家疗养院保护了起来。
在与第五律者战斗中被冻伤的千劫流落到疗养院，阿波尼亚收留了他，并让他在那当一名搬运工。
后来黄昏街爆发崩坏，逐火之蛾高层派樱前来调查，樱为了保险起见在杀完疗养院感染崩坏病的孩子们后与千劫一战打成平手，之后将千劫和阿波尼亚一同带回了逐火之蛾。
逐火之蛾怀疑收容了崩坏病感染源的阿波尼亚知晓了有关逐火之蛾根基的秘密，于是以“崩坏病事件的主使”为由以各种方式对她进行了长时间的审讯。但阿波尼亚似乎真的一无所知，于是逐火之蛾将她推上了融合战士的手术台。
如果她死了，就可以抹杀知情者；如果活下来，她的力量也能为逐火之蛾所用。但融合了崩坏兽「密多罗」的基因后，阿波尼亚获得了影响他人行为以及预测未来的能力，就此以后逐火之蛾不再具有囚禁阿波尼亚的能力。
之后的很长时间里，阿波尼亚都将自己关在了「至深之处」，负责“握住弱者的手”，比如成为「怪物」或站在人类对立面的「昔日英雄」；也负责承受那些真正「罪人」的恶念。
......
“永远不会放弃对抗崩坏的希望”，很美好的愿望，但这个「戒律」却阴差阳错地激发了人们对崩坏的仇恨。
于是，虽然mei博士下令不能伤害已经确定为「第十二律者」的少女，但人们对她的恐惧与愤恨也日渐强烈。
虽然她现在还是个普通的少女，但谁也无法保证这就是她真正的样子，这种想法在人们的心中不断生长——
随后的某一天，违抗了命令的人们冲进了牢房，将这个手无寸铁的「少女」杀害了。
少女眼中的最后一个景象，是在她的尸体旁边欢呼雀跃的人们：“我们又战胜了一个律者......”
然而谁也没想到，第十二之律者——「侵蚀之律者」的力量，从少女死去的瞬间开始显现了。
少女的尸体慢慢分解成带有强烈崩坏能的黑雾，牢房附近的人们，都被这些黑雾感染，变成了「死士」，开始疯狂攻击基地内的其他人。
但仅仅是「死士」还不足以对防守力量完备的「基地」造成强大的威胁，仅仅在混乱爆发的十五分钟之后，最后一名「死士」也在基地的F-23监控室中被消灭了。
（在此期间，愤怒的千劫也曾对着还未「死士」化的研究人员动手，但被阿波尼亚赶来制止，愤怒的千劫让阿波尼亚为自己种下了“不能伤害无辜之人”的戒律，并想看看自己能否对阿波尼亚出手，可惜失败了......可能阿波尼亚确实是无心的。）
然而，这才是一切的开始......
一分钟后，基地内所有的电脑系统都被某种来历不明的病毒入侵了。
这才是第十二律者的真正状态——一种拥有自我意识的究极病毒！
它不仅可以侵蚀人类，连野兽和机械也可以控制！
现在，这种病毒带着对人类的憎恨，彻底控制了「基地」的防卫系统。
然后，她的复仇开始了——
「基地」之中存放着大量的核弹，它们原本是对抗「律者」的最终武器，而现在，所有的核弹全部被发射向了人类仅存的三座城市。
然后，三座城市都瞬间被毁灭了，人类和建筑都在核爆的高温之中一瞬间被汽化了。
少女的姐姐，樱，也在这场事件之中丧生......
最终，全世界的人类，仅剩了在基地之中的三万一千零二十二人。
同时，被第十二律者控制的「基地」，关闭了所有的通向外界的通道。
“既然这些可恶的人类不愿意放这个无辜的少女离开，那他们就一起死在这个黑暗的坟墓中吧！”
「侵蚀之律者」略带一丝尖锐的机械音在基地之中回荡着，不断挑战着幸存者的心理防线。
基地内乱成一团，但mei博士没有放弃战斗，她设下陷阱，让第十二律者自己将核心意识存放在了「基地」的主控系统之中，随后，mei博士剥离了系统，并将它封印在了一个小黑盒里。
（识之律者：不会吧，不会有律者刚出生就被人给骗了吧......）
那之后，mei博士想要将第十二律者也制成神之键，但第十二律者的意识仍在反抗，因此，一直到‘最后的律者’将上个纪元的人类文明彻底摧毁之前，第十二把「神之键」也没有被制作出来。
第十二律者就这样一直在小小的黑盒子中度过了数万年的黑暗岁月，最后，它连时光的流逝都无法感知，心中只剩下了纯粹的憎恨。
一直到五万年后，在圣芙蕾雅学园的某些女武神的帮助下，被侵蚀之律者控制的八重樱终于战胜了律者的意志，找回了真正的自我。
因此，在第十二律者的意识放弃抵抗的瞬间，黑盒子开始执行mei博士留下的指令——
在五万年后，第十二柄「神之键」——「侵蚀之键」地藏御魂，终于被完成了。
不过那都是后话了。
第十二律者的这段故事，是某个少女的悲剧，亦或者是整个世界的悲剧——但我们仍未知道，究竟谁才是受害的人。
......
“在我很小的时候，我的父亲曾告诉过我，那种名为「崩坏」的力量，终有一天会毁灭所有的人类。”
“然而，真的是这样吗？我认为并非如此......”
“人类的敌人，应该是另一种东西，另一种真正能够毁灭人类的东西。”
“——那就是「人类自己」啊！”
以上独白，来自，奥托·阿波卡利斯。
......
在第十二律者的事件结束后，mei博士和梅比乌斯都已经预料到了人类彻底失败的结局，因此，各种计划开始展开，包括但不限于“圣痕计划”、“火种计划”，以及最为关键的，关于“第十三律者”的计划......
仅剩的三万多名人类，已经对对抗崩坏丧失了希望，于是，某一位如同飞花一般绚烂的少女，找上了mei博士制造的超级人工智能。
......
【“普罗米修斯，在你看来...只计算概率的话，该怎么做才更有可能会让人类重新团结起来呢?~”
“出现一个比律者更可怕的敌人，或者找到—种更严重的威胁。”
“哎呀，看来我们想到一块去了呢?~你可真是越来越像我了，普罗米修斯！”
“一个强大到让幸存者们无暇争执，不得不团结在一起的敌人....这确实是最为有效的方法。”
“但同时，这却也是最难的方法。”
“毕竟谁也说不准，一个比律者还要麻烦的敌人..….是会让人类团结一致，还是会让人类更快走向灭亡呢?”
………
“哎，我当然不愿意看到世界又次落入那样的境地啦。不过嘛，要是形势真的已经无法挽回了的话......”
少女抬起指尖，信手捻出了朵粉紫色的水晶花。
.….“故事的女主角，偶尔客串一下迷人的反派角色，也不错吧?~”】
......
最终，逐火十三英桀的第二位，掌握着「真我」之铭的爱莉希雅，向全人类昭告了自己「第十三律者」的身份，并邀请所有还活着的英桀前来参加自己最后的舞会。
最终，仅有四位英桀到场，「救世」之凯文，「戒律」之阿波尼亚，「黄金」之伊甸，以及，「螺旋」之维尔薇。
这位从一降生就是“神之使徒”的最初的律者，为了人类能够战胜崩坏的最后一点希望，将自己的生命押上，赌了最后一次。
也正是因为爱莉希雅的牺牲，才让现文明的律者，都有了作为「人」的意志。
在上文明的最后一位律者——终焉之律者出现后，人类八位战士与终焉律者于月球一决死战。
（除了死去的樱和爱莉希雅之外，应该是执行方舟计划的格蕾修、执行流沙计划和观察者计划的苏以及意识化为了往事乐土的阿波尼亚没有参加。）
两位战士于开场五分钟死去。
mei开启月光王座命中终焉却只转化了终焉的2%崩坏能，六位战士被逼入绝境。
月光王座200%输出，转化终焉律者30%崩坏能并浸入月球背面，其后Kevin的全力一击将终焉律者停止十二小时。
在伙伴不断死去的情况下，Kevin决定撤退。
人类失去对终焉有效的攻击手段，只剩下十二个小时。
值得庆幸的是，mei的圣痕计划成功了，这个时代的人类文明虽然结束了，但他们为下个文明留下了希望的火种。
等凯文回到基地的时候，却发现，长年的操劳和崩坏病的恶化，已经夺走了mei的生命，凯文看见的，也只是完成了一切之后，安然离去的梅。
在凯文也想干脆追随梅而离去的时候，他却发现了一个婴儿，还有梅的亲笔信。
这个婴儿，是她结合了自己和凯文的基因所诞生的试管婴儿，她希望在下个文明之中，这个孩子能够起到作用。
为了完成mei的愿望，凯文带领还活着的华和这个婴儿，一起进入了休眠舱之中，成为了前文明的幸存者。
此后人类与上纪元文明彻底灭亡。
自第三次崩坏始，至月球一战终，耗时不到十年，崩坏......全面胜利。