攻取哈密后，得叶尔羌降卒一千两百人，林士奇经过深思熟虑后，还是决定将这些人归于巴巴克苏的麾下，但作为钳制，在这支军队的上层将领，全部改调乾军军官。
同时巴巴克苏只是名义上的统领，军队真正的指挥权，在副将齐友邻的手中，而齐友邻是张应维的旧部。
此番跟随林士奇出征的有王富贵，吴眺，张应维，以及军中悍将梁三虎，西征的将士都是精中择精，勇猛悍战之卒。
大军攻取哈密后，林士奇下令留民夫三千人在哈密屯田，并命古尔布哈所部蒙古骑兵，抽调近半，护卫大军从嘉峪关至哈密的沿途粮道。
此时的林士奇心中有所隐忧，粮道过长，而护卫的骑兵却太少，若是准噶尔从天山山脉绕过哈密，还是能够威胁到西征军团的粮道，而且在西南面，还有高原的乌斯藏。
林士奇对乌斯藏有所了解，知道僧格的弟弟噶尔丹在高原中颇有声望，噶尔丹的老师是五世达赖，若是其出兵，那么自己在侧翼上，就受到了战略威胁。
因此，虽然战事进行的还算顺利，但林士奇还是向后方请求援兵，或者说并不是援兵，而是维持粮道安危的骑兵队伍。
不过，林士奇知道，兵贵神速，乌斯藏会不会出兵还另说，而准噶尔现在应该面临北路黄成的威胁，应该暂时抽不出力量来驰援西域。
随后林士奇命古尔布哈继续率领先锋骑兵，进军吐鲁番城。
吐鲁番是西域门户，驻守此城的守将穆哈拉，是阿帕克和卓的心腹，穆哈拉已经得到了阿帕克和卓与僧格的严令，死守吐鲁番。
吐鲁番地处天山南麓，乃是通往西域的交通要道，也是林士奇无论如何也绕不开的一座城池，而这也是吐鲁番号称西域门户的缘由。
而作为西域门户，那吐鲁番自然是防御的重中之重，僧格从波格丹手中买的五门火炮就安置在吐鲁番城头。
本来僧格准备在吐鲁番城一共放置四十门火炮，但可惜的是，波格丹的火器还没运到准噶尔，乾朝就已经出兵，甚至已经兵临吐鲁番城下了。
不过，虽然少了火炮，但是吐鲁番作为门户，在叶尔羌汗国的时代，就已经屡屡修缮，因此，此时的吐鲁番城也颇为坚固，甚至和中原的城池比起来，也不乏多让。
而且城中守军众多，有三万余众，也是阿帕克和卓在西域诸城中，兵力最多的一座城池，或者应该说阿帕克和卓已经将大部分的兵力都放在防守吐鲁番上面。
至十二月初十，古尔布哈率骑兵五千，奔袭至吐鲁番城下，并数次击败叶尔羌在城下的游骑。
城中守将穆哈拉认为此时虽然城下的蒙古骑兵数量不多，但是乾朝的援兵应该很快就会抵达，为了以防万一，穆哈拉下令，所有人撤入城中，停止出城游斗。
在古尔布哈抵达城下十余日后，林士奇所率的主力也抵达了吐鲁番城下，但是火炮等重型辎重还未抵达，因此，林士奇下令，深挖壕沟，严整军寨，暂缓攻城。
而在城中的穆哈拉一直以为乾朝国力强大，人口众多，因此在城外的这些兵力，穆哈拉认为这应该不是乾军的全部主力，甚至一度认为这是乾军的诱敌之计。
穆哈拉想了想，还是决定依靠城池，死守，正所谓不动如山，随便敌人有什么阴谋诡计，他坚守城池不出，乾军再强，又能奈我何。
乾朝号称出兵二十万人，但实际上，马步军才四万众，僧格当初判断，乾军必然出动大军来犯，因此，严令叶尔羌不得与乾军决战，要利用坚城来消耗乾军，并等待准噶尔的骑兵来突袭乾军的粮道。
只是乾朝实际上出动的兵力，远远小于僧格的估计，僧格听说二十万乾军西进的消息后，还嘲笑孟浚不懂战术，二十万人，应该号称五十万大军才对。
城中重兵防守，城外大军云集，但在进士奇抵达吐鲁番一整月的时间，双方竟然诡异的没有爆发任何冲突。
在外征战的将士，便连过年也没法好好过，只是在大年三十这一天，军中的伙食丰盛了一些，至于酒水，那是半点也没。
时间来到了正月十六，火炮终于抵达了吐鲁番城下。
此时西征军团的大营中，诸将齐聚一堂，林士奇摊开巴巴克苏提供的那份地图，沉声问道：“斥候有没有发现准噶尔骑兵，或是乌斯藏人？”
古尔布哈闻言，摇摇头道：“大帅，末将抵达吐鲁番后，侦骑四出，除了刚开始的时候和吐鲁番城内的游骑有所冲突外，这段时间，一个敌人都没看到。”
这时张应维摸了摸鄂下的短须，皱着眉头说道：“不应该啊，我看吐鲁番城防守很是严密，不像是准噶尔要放弃此城的样子。”
王富贵摇头道：“不可能，咱都知道吐鲁番是西域门户，那在西域待了一辈子的那个什么和卓怎么可能不知道，哪个城丢了，他都不会放弃这个城，依我看，这就是敌人认为吐鲁番咱们打不下来，死守城池，准备要耗死咱们。”
“死守？”张应维停住了摸着胡须的手，说道：“没听说过久守必失吗？现在咱们火炮都到了，我看了这吐鲁番城，虽然坚固，但也比不上金陵，镇江，山海关，这等坚城雄关。”
林士奇这时开口打断了众人的议论，说道：“僧格这是想要靠坚城拖住我们，从嘉峪关到这吐鲁番，路途遥远，朝廷运来的粮食损耗极大，他们一定是在等，等咱们坚持不住，就会趁机反攻。”
梁三虎哼了一声，道：“想的倒挺好，但现在可不是以前了，咱们兵精甲锐，还有火炮开路，吐鲁番想死守，那咱们就把城迅速的攻下来，守军要死守城池，必然在城中囤积大量的粮草，夺了城，也能减轻粮道的压力。”